冥龙是最具代表性的黑暗生物，这种身披黑色甲壳的巨兽以固定路线在暮土与伊甸之眼游荡，其蓝色探照光一旦锁定玩家便会转为猩红，发动致命撞击。冥龙的设计灵感源于被污染的远古光之生物白冥龙，原本守护圣地的它们在黑暗侵蚀下异化。与冥龙同样危险的还有黑暗螃蟹，这些栖身于暮土污水中的生物会集群攻击玩家，但通过大叫掀翻或抱起它们可暂时化解危机。
散落在各图的黑暗腐蚀（俗称黑花）虽无主动攻击性，却会持续消耗玩家能量，需多人协作点燃才能清除。潜海季新增的冥龙母体虽暂未展现攻击性，但其庞然身躯与诡异形态暗示着更深层的黑暗威胁。
螃蟹曾能聚合成克苏鲁风格的巨型怪物，以数百只集群发动连击；黑暗大蜘蛛能编织透明丝线困住玩家，黑暗章鱼与蛤蟆则潜伏于阴影中伺机吞噬。更令人震撼的是先祖遗留的防御工事——暮土炮塔与哨船。这些用黑暗石建造的装置会发射掠夺生命能量的射线，甚至能逆转生物属性，将光之子转化为暗影。然而这类高难度战斗系统因与游戏温暖社交核心理念冲突而被舍弃，仅留下部分遗迹。
